Medline et la recherche en vocabulaire libre
La capsule Medline et les MeSH explique l'importance d'utiliser des descripteurs MeSH lorsque vous faites une recherche dans Medline. La capsule Medline : pas assez de références? trop de références? présente quant à elle différentes astuces pour améliorer une stratégie de recherche effectuée en utilisant les descripteurs MeSH. Toutefois, il existe certaines situations où même après plusieurs essais, la recherche par MeSH ne donne pas les résultats escomptés. Cela peut survenir lorsque vous cherchez une notion trop récente pour avoir été incorporée dans les descripteurs, un sujet très pointu ou très technique, un terme commercial, etc.
Dans ces situations, il peut s'avérer préférable d'effectuer une recherche en vocabulaire libre, c'est-à-dire une recherche dans tous les champs des références bibliographiques (titre, titre original, résumé, etc.), ce que nous appelons aussi la recherche dans le texte. Medline sur la plateforme OvidSP vous offre deux possibilités pour effectuer la recherche dans le texte :
- La recherche simple disponible sous l'onglet
qui offre entre autres le tri par pertinence, ainsi que la fonction 
. - La recherche avancée dans le texte sous l'onglet
qui, comme son nom l'indique, permet d'utiliser des fonctionnalités de la recherche avancée tel la troncature, la recherche d'expression exacte, les opérateurs booléens, etc.
La recherche simple sur la plateforme OvidSP
Mode de recherche simple, est une solution rapide qui peut être intéressante. Malgré le peu de contrôle sur la recherche effectuée, les résultats peuvent être satisfaisants, grâce notamment au tri par pertinence. La recherche est effectuée dans les champs Title (titre) et Abstract (résumé) uniquement.
Attention : Les résultats obtenus en mode Basic Search ne représentent pas toujours la totalité des références portant sur le sujet recherché. Pour plus d'exhaustivité, il est conseillé d'effectuer la recherche en mode avancé.
Les valeurs ajoutées à la recherche simple
Include Related Terms
L'option Include Related Terms permet au moteur de recherche d'inclure les termes associés à la chaîne de caractères qui a été inscrite dans la boîte de recherche. Généralement, ceci se résume à inclure la forme plurielle, mais il peut aussi permettre l'inclusion de nombreux synonymes comme dans l'exemple qui suit :
Tri par pertinence
Uniquement disponible lors de la recherche effectuée sous , le tri par pertinence permet de présenter les résultats correspondants le mieux à votre recherche en premier lieu.
Attention : En mode Basic Search, la recherche de plusieurs concepts peut générer des résultats même lorsque seulement quelques uns des concepts sont repérés. Les 5 étoiles à côté de Relevance nous indique que tous les concepts sont bien présents dans la référence obtenue.
La recherche en vocabulaire libre avec Advanced Search
Le mode recherche avancée permet un plus grand contrôle sur la recherche en vocabulaire libre. Plusieurs outils existent afin de peaufiner la recherche de manière à répondre le mieux possible à votre besoin d'information. De plus, le nombre de résultats obtenus correspond davantage à la réalité, car il s'agit de la totalité des références ayant la ou les chaînes de caractères recherchées dans l'un ou l'autre des champs. Pour effectuer directement une recherche dans le texte vous devez décocher Map Term to Subject Heading dans la page principale :
Voici des exemples où il serait approprié d'effectuer la recherche directement en vocabulaire libre :
- Une maladie rare:
le syndrome d'Antley-Bixler - Un nouveau médicament:
Methylnaltrexone - Du matériel ou un appareil utilisé en médecine
durapore (membrane artificielle utilisée en périodontie)
liposhaver (instrument chirurgical utilisé pour la liposuccion) - Un nom propre autre qu'un nom d'auteur
robert huber (prix Nobel de chimie) - Un terme très pointu (ex. une séquence consensus de nucléotides, un codon en particulier)
KOPS
codon 634
Les outils de la recherche avancée
Recherche par expression exacte
La recherche par expression exacte s'applique par défaut lors de la recherche en mode avancé. La requête correspond donc à rechercher exactement la chaîne de caractères telle qu'elle est inscrite dans la boîte de recherche.
Exemple :
relative risk (les deux mots collés) = 36420 résultats
relative AND risk (les deux mots n'importe où dans le texte) = 73065 résultats
Opérateurs booléens AND, OR, NOT, ADJn
- AND
L'utilisation de cet opérateur entre deux ou plusieurs termes de recherche permet de repêcher les documents qui contiennent tous ceux-ci.
Exemple :
phototherapy and psoriasis permet de retrouver les documents où les termes psoriasis et phototherapy sont tous les deux présents.
- OR
L'utilisation de cet opérateur entre deux ou plusieurs termes de recherche permet de repêcher les documents qui contiennent au moins un des termes recherchés. Il élargit donc la recherche.
- NOT
L'utilisation de cet opérateur entre deux ou plusieurs termes de recherche permet de repêcher les documents qui contiennent un sujet sans un autre sujet.
Exemple :
eating disorders not anorexia permet de retrouver les documents où le terme eating disorders apparaît ET où le terme anorexia n'est pas présent. Il faut donc utiliser cet opérateur avec modération.
- ADJn
L'utilisation de cet opérateur entre deux ou plusieurs termes de recherche permet de repêcher les documents qui contiennent tous ceux-ci, en général dans la même phrase. Le n permet de spécifier le nombre de mots qui peuvent être présents entre nos termes de recherche. Cet opérateur est plus précis que l'opérateur AND mais plus souple que la recherche par expression exacte.
Exemple :
green adj4 tea permet de repêcher les documents contenant:
- green tea
- green and black tea
- green, black and fruit tea
- three types of tea, green, oolong and black tea
- etc.
Troncature
La troncature, c'est l'action de couper (tronquer) un mot afin de trouver toutes ou certaines de ses variantes. Des caractères particuliers (en anglais wildcards) permettent de chercher différentes formes d'un mot en une seule opération. En fait, l'utilisation optimale de l'option de recherche en vocabulaire libre dans le texte (Keyword ou .mp.) ne se fait pas sans connaître les subtilités de la troncature.
- Troncature avec * ou $
C'est le signe de troncature le plus utilisé. Il est placé à la fin du mot et peut remplacer 0, 1 ou plusieurs caractères. Il sert généralement à repérer le singulier et le pluriel d'un mot mais également des mots ayant la même racine.
Exemple :
nerve* repère nerve et nerves
neurol* repère neurology, neurologist, neurological, neuroleptic, etc.
-
Attention : Lorsque la troncature est effectuée trop près du début d'un mot, il pourrait y avoir de nombreux termes non pertinents pour votre recherche.
Exemple :
fat* vous donnera fat, fats et fatty, mais aussi fatality, fatalities, father, fatigue, etc.
Si vous voulez diminuer le nombre de références non-pertinentes tout en étant sûr de repérer les mots fat, fats et fatty, indiquez le nombre maximum de lettres que vous désirez voir après la troncature pour limiter la recherche aux mots avec seulement 0, 1 et 2 caractères de plus.
Exemple :
fat*2 vous donnera fat, fats et fatty (mais pas fatality, fatalities, father, fatigue, etc.)
- Troncature avec #
Ce signe de troncature, qu'on appelle masque, est utilisé à l'intérieur du mot et se substitue à 1 caractère. Il est utile pour repérer des variantes orthographiques d'un mot, dont certaines formes irrégulières du pluriel.
Exemple :
wom#n (repère woman et women)
foref##t (repère forefoot et forefeet)
- Troncature avec ?
Lorsqu'un mot possède des variantes orthographiques qui n'ont pas le même nombre de lettres, on doit utiliser un autre masque, le point d'interrogation ?. Celui-ci remplace 1 ou 0 caractère. Lorsqu'il est utilisé à l'intérieur d'un mot, sa principale utilité est le repérage des variantes britanniques et américaines d'un mot.
Exemple :
cutane?us (repère cutaneus et cutaneous)
tumo?r (repère tumor et tumour)Ce signe peut aussi être utilisé à la fin des mots pour repérer uniquement les formes singulier et pluriel. Comparons-le avec la troncature *.
Exemple :
cell? (repère cell et cells)
cell* (repère cell, cells, cellular, cellulose, cellulitis, etc.)
- Utilisation des différentes troncatures dans une même recherche
Supposons que votre recherche porte sur les nerfs cutanés. En anglais, cutanés peut s'écrire cutaneus ou cutaneous. De plus, vous voulez être sûr d'obtenir l'expression tant au singulier qu'au pluriel. Voici donc comment vous écrirez votre question.
Exemple :
cutane?us nerve*
Avantages et inconvénients de la recherche dans le texte
La recherche en vocabulaire libre permet de repérer tous les documents présents dans la base de données Medline, notamment ceux regroupés dans le segment Ovid MEDLINE(R) In-Process & Other Non-Indexed Citations, contrairement à la recherche à l'aide des descripteurs MeSH qui s'applique uniquement aux documents indexés.
Il est toutefois important de penser à toutes les formes possibles d'un même mot lorsqu'on utilise la recherche en vocabulaire libre dans le texte. C'est d'ailleurs cette multitude de possibilités propre au vocabulaire libre qui a amené la création des vocabulaires contrôlés tels que les MeSH.
De plus, lorsque vous utilisez la recherche dans le texte, vous devez être conscient que vous ne bénéficiez pas des options disponibles lors de la recherche par MeSH. Ces options : Explode, Focus, Subheadings, Mapping et Scope (voir la capsule Medline et les MeSH) existent pour soutenir et améliorer votre recherche.
Référence Santé
InfoRepère
Dernière mise à jour: 12 juillet 2010
