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Medline et les MeSH : Mapping, Explode, Focus, Subheadings et Scope

[[Table des matières]]

Voici un résumé des caractéristiques des descripteurs MeSH (Medical Subject Headings) utilisés dans Medline.

La capsule Medline : pas assez de références? trop de références? complète cette capsule en vous donnant des trucs pour améliorer votre stratégie dans Medline lorsque le résultat de votre recherche ne vous satisfait pas. Pour pouvoir ainsi retravailler vos recherches, vous aurez besoin d'une bonne connaissance des descripteurs MeSH.

Qu'est-ce qu'un MeSH?

Les MeSH (Medical Subjects Headings) sont les descripteurs utilisés par la National Library of Medicine (É.-U.) pour indexer les articles dans Medline. Les descripteurs servent à décrire les sujets dont traite un article. Ils sont regroupés dans un thésaurus de façon hiérarchique (termes généraux et termes spécifiques) par grandes catégories (ex. : Anatomy, Diseases, etc.). Ces descripteurs peuvent être constitués d'un mot ou de plusieurs mots, selon que le concept présenté inclut une ou plusieurs notions.

Exemple
MeSH simple :
MeSH composé :
neoplasms
prostatic neoplasms

La recherche avec les MeSH

Il faut d'abord s'assurer que l'onglet bouton advanced ovid search est sélectionné afin de pouvoir profiter des avantages que procure la recherche avancée à l'aide des descripteurs MeSH.

Lorsqu'on cherche dans Medline (version Ovid) avec un terme MeSH, nous pouvons influencer le résultat de la recherche avec les options Explode, Focus et les Subheadings. La fonction Mapping aide à chercher des descripteurs dans le thésaurus, alors que l'option Scope nous permet d'obtenir le contexte d'utilisation d'un terme.

Les descripteurs dans Medline sont uniquement en anglais. Si au départ notre sujet s'exprime en français, on peut en traduire les mots avec un dictionnaire français-anglais et l'inscrire dans la boîte de recherche ou essayer de trouver directement le descripteur MeSH correspondant à partir du Portail de terminologie de santé (CiSMeF).

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Mapping

La fonction Mapping sert à obtenir des suggestions de descripteurs MeSH pour mieux cerner un sujet. Pour l'utiliser, on n'a qu'à saisir un ou des mots dans la fenêtre de recherche, cocher (ou laisser cochée) la case mapping et cliquer sur le bouton Search.

Lorsque le terme cherché existe dans le thésaurus, l'écran Mapping présente alors une liste des descripteurs où ce terme apparaît.

Exemple : tous les descripteurs contenant le mot Ligaments

Ligaments ÉMapping Display

Si le terme cherché est seul dans le thésaurus ou renvoie à un seul descripteur synonyme, il n'y aura qu'un descripteur MeSH qui apparaîtra à l'écran Mapping.

Peu importe le nombre de descripteurs repérés dans le thésaurus, l'écran Mapping propose toujours, en fin de liste, le terme exact que vous avez saisi, mais cette fois non pas comme descripteur MeSH mais comme mot-clé. Si vous sélectionnez ce terme, vous ferez la recherche de ce terme dans les titres et les résumés des articles. Cette recherche se présente avec le suffixe .mp. (search as Keyword). Il est généralement préférable de faire la recherche à l'aide d'un descripteur du thésaurus, mais il peut être utile ou nécessaire d'exécuter à l'occasion des recherches par mots-clés. Pour plus de détails sur ce type de recherche, consultez la capsule Medline : la recherche en vocabulaire libre.

On n'obtient pas la structure arborescente des MeSH dans l'écran Mapping. Le seul lien entre les quatres sujets ci-dessus est la présence du mot Ligaments. Pour voir une présentation hiérarchique de termes, cliquer sur le descripteur voulu dans la liste offerte à l'écran.

Attention : Si vous cherchez le terme Neoplasms, l'écran du Mapping va afficher plus de 160 MeSH contenant ce mot! Comme ils apparaissent en ordre alphabétique (abdominal neoplasms, adrenal cortex neoplasms...) il vous faudra descendre dans la liste pour retrouver votre terme de départ... Un petit truc : si vous entrez le terme Cancer, l'écran du Mapping vous proposera uniquement son terme synonyme exact i.e. Neoplasms.

Lorsque le terme cherché n'est pas un descripteur ou un synonyme accepté du thésaurus, l'écran présente une liste de descripteurs possibles, c'est-à-dire des descripteurs qui ont souvent été trouvés en compagnie du terme cherché.

Exemple : liste des descripteurs proposés quand je tape Green tea

mapping display green tea

Comme il n'y a pas de descripteurs précis pour mon expression de recherche, je pourrai faire ma recherche avec le descripteur Tea combiné au mot du texte Green. Ou encore chercher telle quelle l'expression Green tea en cochant le dernier terme de la liste.

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Explode

Quand on applique l'option Explode à un descripteur, on cherche non seulement ce terme, mais aussi tous les termes plus précis présents dans le thésaurus. Pour obtenir l'affichage détaillé de l'arborescence du thésaurus (Tree), cliquez sur votre terme.

L'écran Tree situe le terme cherché dans l'arbre hiérarchique des MeSH, en nous proposant un niveau plus haut dans la hiérarchie (termes généraux) et un niveau plus bas (termes spécifiques).

Par exemple, pour le terme de recherche Speech disorders :

Mapping Display Ex

 

Tree Speech

Si vous cherchez le terme Speech disorders sans cocher la case Explode, vous n'obtiendrez que les articles où ce descripteur a été utilisé, donc traitant des troubles de la parole en général.

Les termes plus spécifiques (Aphasia, Articulation disorders, etc.) ne seront inclus que si vous cochez l'option Explode au niveau du terme Speech disorders. Cette option équivaut à combiner le terme cherché et tous les termes qui lui sont plus spécifiques avec OR : Speech Disorders OR Aphasia OR Articulation Disorders OR Echolalia OR ...

N'oubliez pas que lorsque vous choisissez l'option Explode, tous les termes plus spécifiques seront inclus. A l'écran Tree, seuls les termes du premier niveau inférieur dans l'arbre apparaissent mais sous ces termes il peut y avoir d'autres niveaux qui seront aussi inclus dans la recherche. Ainsi, on trouve 4 termes plus spécifiques sous Aphasia (Aphasia, Broca; Aphasia, Conduction; Aphasia, Primary Progressive; Aphasia, Wernicke), ils seront inclus si on active Explode pour Speech Disorders.

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Comment visualiser les termes à tous les niveaux, plus généraux et plus spécifiques ?

À l'écran Tree, il faut cliquer sur Bouton Full Tree. Voici une portion de l'arbre hiérarchique des MeSH qui est déployé à plusieurs niveaux pour le descripteur Speech Disorders :

Full Tree Speech

Pour visualiser les termes plus spécifiques, il suffit de cliquer sur Icône Plus à gauche d'un descripteur.

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Pourquoi y a-t-il parfois plus d'un terme général?

Voici l'écran Tree pour le terme Milk :

Tree Milk

Il possède 3 termes généraux : Bodily Secretions, Beverages et Dairy Products.

S'il y a plus d'un terme général, cela signifie que le terme cherché apparaît dans plusieurs catégories de l'arbre hiérarchique, selon le point de vue sous lequel on le considère. Si vous cochez la fonction Explode au niveau du terme Milk sous le terme général Bodily Secretions, tous les termes plus spécifiques seront cherchés même si ces termes apparaissent seulement pour Milk sous les termes généraux Beverages et Dairy Products.

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Pourquoi voit-on parfois (Non MeSH) écrit à côté de certains termes?

Voici l'écran Tree pour le terme Nervous System :

Tree Nervous System

Son terme général Anatomy est un Non MeSH. Les termes Non MeSH sont utilisés uniquement pour regrouper des termes plus spécifiques avec l'option Explode. Ils ne peuvent pas être cherchés seuls puisqu'ils ne sont pas utilisés pour indexer des articles.

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Focus

Vous pouvez aussi limiter votre recherche aux descripteurs qui sont le sujet principal d'un article en cochant la case Focus.

Pour la base de données Medline, des indexeurs attribuent à chaque article 3 ou 4 MeSH principaux ou majeurs sur un nombre moyen de 10 à 12 MeSH. En choisissant le Focus, on obtient uniquement les articles très pertinents mais certains bons articles peuvent être perdus.

Attention : Lorsque combiné à la fonction Explode comme dans l'exemple qui suit, le Focus sera appliqué au terme cherché ainsi qu'à tous les termes plus spécifiques :

ExplodeFocusSpeach

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Subheadings

Quand on choisit un MeSH, on obtient ensuite une liste de qualificatifs (affichés dans l'écran Subheadings), qui permettent de restreindre la recherche à un ou plusieurs aspects particuliers du sujet. Il existe un total de 83 qualificatifs mais la liste affichée varie selon le sujet. Il est possible de choisir certains qualificatifs ou de les inclure tous (c'est l'option par défaut).

Voici les qualificatifs proposés pour le terme Speech disorders :

Subheadings Ex

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Et si aucun des qualificatifs suggérés ne semble pertinent pour mon sujet?

Ou bien vous n'en sélectionnez aucun, ou vous sélectionnez Include all subheadings, ce qui donne le même résultat. Vous allez alors obtenir tous les articles indexés avec votre descripteur (ex : Speech disorders), qu'ils soient accompagnés ou non d'un aspect particulier. Il y a toujours de nombreux articles où aucun qualificatif n'a été ajouté au sujet, soit parce qu'aucun n'était pertinent, soit parce que plus de 3 qualificatifs étaient pertinents pour ce sujet.

Que se passe-t-il si on choisit des qualificatifs après avoir activé l'option Explode?

Les qualificatifs seront appliqués au terme cherché ainsi qu'à tous les termes plus spécifiques.

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Interprétation de l'affichage d'une question

Affichage de requête

exp : indique qu'on a choisi Explode, pour inclure les termes plus spécifiques que le terme recherché Speech disorders

* : signifie qu'on a choisi Focus, pour limiter la recherche aux articles où ces sujets (terme cherché + termes plus spécifiques) sont centraux.

dt, rh : indique que la recherche est restreinte aux qualificatifs Drug therapy et Rehabilitation pour chacun des termes cherchés, soit Speech disorders et tous les termes plus spécifiques.

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Scope

Vous avez peut-être déjà remarqué l'icône Scope Note (db info) dans les écrans Mapping et Tree. Cette option permet d'obtenir le contexte d'utilisation d'un descripteur.

Voici par exemple l'information qu'on retrouve pour le terme Genes, P16

Exemple de Scope Note

Ainsi, en cherchant le MeSH Genes, P16, vous aurez uniquement des références entrées dans la base depuis 1998. Pour avoir les documents antérieurs (1994-97), il faut chercher avec le MeSH Genes, Suppressor, Tumor.

A chaque année des termes MeSH sont ajoutés, modifiés ou retirés du thésaurus. Il est donc important de consulter l'option Scope.


Référence Santé
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Dernière mise à jour: 12 juillet 2010


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